之后的发展和动画中没有太多的差距。
工藤有希子重新装扮成之前那个女人模样，将柯南正式寄托在毛利家中，并且给了毛利小五郎一份不菲的抚养费。
在那之后，工藤优作和工藤有希子也没有在日本多待，甚至在江杭的提议下，他们还做出了一副心情低落匆忙离开的模样。
接着关于高中生名侦探工藤新一神秘消失，至今不知所踪的信息也是渐渐在警察那边那边流传起来。
这也是为了确保黑衣组织那边不会意识到工藤新一还活着所必要的手段。
而时间过去了一天，柯南现在也是在江杭的事务所中，接受着他的教育。
“你想要继续留在日本秘密调查酒厂的情报，这个当然没有问题，黑衣组织其实也没有你爸说的那么可怕，他们组织可没那么闲，基本上不会注意到你这种无关紧要的小喽喽的，”江杭毫不客气指出柯南在酒厂那边只能算是一个小喽喽的事实。
而听到这样的话，柯南虽然很想要反驳，却也只能忍气吞声的接受下来，谁叫江杭的拳头大，而且他爸在离开之前，还让他遇到麻烦就去找江杭帮忙呢。
至少在现在的日本，知道他工藤新一身份的人除了阿笠博士之外也就只有江杭了。
当然柯南自己的内心也是有着自己的算盘。
既然江杭真的和那些组织没有什么关系的话，那对方现在也因为宫野明美的事情而和那个黑衣组织正面对上了，以他一直表现出来的那种正义感，相信他也是想要尽快将黑衣组织给解决掉。
而自己这边现在身体变小了，但也更不容易被人注意到，在阿笠博士的道具帮助下，只要自己之后提高警惕，也能够在暗地里和江杭进行配合。
跟着自己父母去美国，然后拜托国际刑警调查黑衣组织拿到解药变回原来的模样，这固然是最安全的选择。但柯南一想到那个黑衣组织能够让那么多国家的情报机构屡屡受挫，他实在无法将希望寄托在那些国际刑警身上。
交给那些家伙，说不定自己真的就没办法把身体变回去了，在这种事情上，柯南始终还是更相信自己的实力一些。
说到底他还是一个相当自恋的性格，在推理和破案方面，到目前为止他除了他的父亲，也只承认了江杭一个人而已。
江杭那边有着先行者基金会作为背景，可以利用基金会的力量调查调查黑衣组织的情报，同时江杭他个人的判断力估计不弱于自己，而观察力更是在自己之上。
最主要的是对方的性格也相当谨慎，能够在这方面跟自己产生互补，如果他们两个人能够同心协力联手对付黑衣组织的话，说不定就能够比国际刑警更快的找出黑衣组织的弱点所在！
正是考虑到了这一点，柯南最后才决定留在日本，没有跟随他的父母一起去美国。
要是让江杭知道柯南脑袋里面打的是这个主意的话，估计他也只能哭笑不得了。
之前你怀疑我是酒厂的人，脑袋里面整天想着要怎么提防我，现在被你爸跟我联合起来给你上了一课之后，你现在就是想着要来抱我大腿了？
虽然被柯南这个家伙主动抱大腿的滋味确实很舒坦，但江杭自己知道自己压根就不算什么大腿。